亚甲基蓝是一种常用的显色剂，被广泛应用于生化实验中。它的显色原理是通过和蛋白质结合，形成蛋白质-亚甲基蓝复合物，进而呈现出深蓝色的颜色。

亚甲基蓝是一种有机化合物，它的分子结构中含有苯环、三氨基甲基和苯酚基等基团。在生化实验中，亚甲基蓝主要用于检测蛋白质的存在和纯度。当亚甲基蓝与蛋白质发生作用时，它的三氨基甲基基团会与蛋白质中的酸性氨基和羧基发生离子键结合，形成亚甲基蓝-蛋白质复合物。这种复合物具有很强的吸收光谱，它的最大吸收波长位于600~660nm的范围内，因此呈现出深蓝色的颜色。

亚甲基蓝显色原理的应用非常广泛。在蛋白质电泳分析中，亚甲基蓝可以作为染色剂，帮助检测蛋白质的分离情况，并定量测定蛋白质的含量。在蛋白质纯化过程中，亚甲基蓝也可以用来检测蛋白质的纯度，判断是否需要进一步纯化。

除了在生化实验中的应用，亚甲基蓝还可以用于细胞核染色和细胞内器官的染色等方面。总之，亚甲基蓝显色原理的应用范围非常广泛，为生物科学研究提供了重要的工具和方法。